Online ISSN: 2189-0544 Print ISSN: 0037-1017
公益社団法人日本生化学会 The Japanese Biochemical Society
Journal of Japanese Biochemical Society 95(4): 483-489 (2023)
doi:10.14952/SEIKAGAKU.2023.950483

特集Special Review

腸内細菌群集の網羅的代謝機能データベースFunctional annotation atlas for human gut microbiome

1沖縄科学技術大学院大学統合オープンシステムユニットOkinawa Institute of Science and Technology ◇ 〒904–0495 沖縄県国頭郡恩納村字谷茶1919–1 ◇ 1919–1 Tancha, Onna-son, Kunigami-gun, Okinawa 904–0495, Japan

2東京工業大学生命理工学院Tokyo Institute of Technology Department of Life Science and Technology ◇ 〒152–8550 東京都目黒区大岡山2–12–1 M6–4 ◇ 2–12–1 Ookayama, Meguro-ku, Tokyo 152–8550, Japan

発行日:2023年8月25日Published: August 25, 2023
HTMLPDFEPUB3

ヒト腸内環境解析は次世代シーケンサーの発展と,腸内環境と疾患の関連性が次々と明らかになるにつれ,技術的にさまざまな広がりを見せている.16S rRNA遺伝子アンプリコン解析のみならず,ショットガンメタゲノム解析による詳細な機能解析により,ヒト腸内細菌が持つ代謝機能についても,定量的に扱うことが可能となってきた.遺伝子機能解析には,塩基配列やアミノ酸配列に対して行う機能アノテーションが基盤となる.

本稿では遺伝子機能解析のリファレンスとして用いられるデータベースや,機能アノテーションツールに焦点を当てる.筆者らのグループはヒト腸内細菌が持つ代謝機能に焦点を当てた代謝経路データベースであるEnteropathwayを開発している.当該データベースを利用することによるデータ解析の可能性についても紹介したい.

This page was created on 2023-07-19T07:43:04.104+09:00
This page was last modified on 2023-08-22T10:31:37.000+09:00


このサイトは(株)国際文献社によって運用されています。